PhpStorm отображение на FTP скрытых файлов

Для того чтобы скрыть или отобразить скрытые файлы в PhpStorm при FTP подключении достаточно в настройках PhpStorm FTP сервера поставить галочку напротив «Show and process hidden files».

Подробный путь в настройках:

PhpStorm -> Preferences -> Build, Execution, Deployment -> Deployment -> (выбираем нужный сервер) -> Advanced Options -> Show and process hidden files